试管婴儿是指在试管受精的技术中将受精卵移植到女性子宫内，通过胎儿发育正常出生的孩子，这种技术已经在世界范围内广泛应用。然而，对于试管婴儿5对染色体有缺陷，该如何处理？

首先，要明确试管婴儿染色体缺失或染色体结构异常是否可以通过试管受精来解决。可以说，试管受精不可能完全避免染色体问题，但是在精液检查中使用新技术，如定向精子采集技术，能够有效的减少不正常的染色体结构。

其次，在受精卵发育过程中，会进行染色体检测，以确定试管婴儿是否出现先天性染色体缺陷。如果发现有畸形，就不能移植子宫，可以采用多细胞遗传检查，以确定要移植的胚胎是否仅有5对染色体的缺失，以避免其他的染色体缺陷，如23对染色体隐性异常等。

另外，还可以采用大分子糖蛋白分析等技术来排除试管婴儿的基因和染色体缺陷，利用大分子糖蛋白分析技术可以知晓染色体缺失，从而可以发现婴儿的先天性缺陷后及时治疗。

再者，胚胎染色体异常做试管可以避免某种染色体不平衡问题，但并不能完全避免染色体缺失，因此，做试管受精时必须要仔细检查受精卵的染色体异常情况，以免受到染色体不平衡未彻底解决的影响。

综上所述，试管婴儿5对染色体有缺陷可以采取精液定向技术、染色体检测和大分子糖蛋白分析等技术排除基因和染色体缺失，以尽量减少先天性畸形和缺陷率。